Das Root-FS beinhaltet sämtliche Dateien, die beim Starten des Linux-Kernels und zum Arbeiten benötigt werden. Ein üblicher Verzeichnisbaum mit Verzeichnissen /bin,  /usr, /dev, /media, /sbin ..... kennt man bereits von Linux-Systemen, die über Festplatten verfügen.

Auf dem ARM-Board wurde auf eine ”minimale”-Version eines Dateisystems geachtet, damit man mit dem zur Verfügung stehenden Flash-Speicher gut auskommen kann.